Да, но есть способ ибежать выделения доли супругу.
Жильё, купленное с маткапиталом, оформляется в общую долевую собственность родителей и детей, ст. 10 ФЗ №256-ФЗ. Доля супругу выделяется, пока брак не расторгнут, независимо от того, участвует ли он в жизни детей и общаетесь ли вы вообще.
Важный нюанс: доля выделяется не от всей квартиры, а пропорционально доле маткапитала в общей стоимости жилья, это подтверждено определением Верховного Суда РФ от 14.03.2017 №4-КГ16-73. Если маткапитал это только часть первоначального взноса по ипотеке, доля супруга получится небольшой, а не 1/4 квартиры.
Самый надёжный способ полностью избежать доли супругу, развестись до покупки квартиры. Если сертификат получен в браке, но жильё куплено уже после развода, бывшему супругу доля не полагается, на момент покупки он уже не супруг по смыслу закона.
Так как есть несовершеннолетние дети, развестись можно только через суд, ст. 21-23 СК РФ, не через ЗАГС. Если супруг не явится и не будет оспаривать развод, что вероятно при отсутствии контакта с 2018 года, суд расторгнет брак без его участия, при необходимости через розыск или по последнему известному адресу.
Что делать:
Подайте иск о расторжении брака в мировой суд, можно сразу решить вопрос по алиментам, раз он не участвует в жизни детей.
Дождитесь вступления решения в силу, месяц после решения, если не обжаловано.
Получите свидетельство о разводе.
После этого покупайте квартиру, обязательство нужно будет оформить только на вас и детей.
Если развестись быстро не выйдет, а покупка срочная, доля супругу всё же будет положена, но именно пропорционально вложенной части маткапитала, заранее посчитайте эту долю, скорее всего она окажется незначительной.
Отдельно: сам сертификат при разводе не делится, средства остаются у того, на кого оформлен, развод влияет только на состав собственников будущего жилья, а не на право распоряжаться маткапиталом.