Неправомерно начисление налога от продажи доли в квартире?

1. Суть ситуации и правовая оценка
Ваша мама продала свою 1/2 долю в квартире, находившейся в собственности менее 3 лет, за 1 млн руб. (вторая доля — другим родственником). Несмотря на то что сумма продажи каждой доли не превышает 1 млн руб., налоговая инспекция начислила налог и пени, поскольку обе доли были проданы по одному договору купли-продажи, и ФНС посчитала это как продажу единого объекта недвижимости за 2 млн руб. В результате налоговый вычет в размере 1 млн руб. был применён не к каждой доле отдельно, а к общей сумме, и возникла налоговая база.

2. Какие нормы права применимы
- Ст. 217.1 НК РФ: освобождает от налогообложения доходы от продажи квартиры, если она была в собственности более минимального срока (3 или 5 лет). В вашем случае срок меньше.
- П. 2 ст. 220 НК РФ: позволяет уменьшить доход от продажи недвижимости на имущественный вычет — не более 1 млн руб. на каждый объект недвижимости в год, а не на каждого продавца.
- Письмо ФНС России от 24.05.2018 N БС-4-11/10126@: разъясняет, что при продаже доли по отдельному договору каждый продавец может применить вычет в 1 млн руб. Если же доли продаются по одному договору, вычет делится между продавцами пропорционально долям.
- Ст. 75 НК РФ: регулирует начисление пеней за несвоевременную уплату налога.
- Ст. 54.1 НК РФ: допускает корректировку налоговой базы и возврат излишне уплаченного налога при ошибке.

3. Риски, сроки, ответственность и нюансы
- ФНС формально права: если обе доли проданы по одному договору, налоговый вычет (1 млн руб.) делится на всех продавцов, а не предоставляется каждому в полном объёме.
- Если бы было два отдельных договора, каждый продавец получил бы право на отдельный вычет.
- Пени начисляются автоматически за просрочку уплаты налога, даже если уведомление не было получено (ст. 69, 75 НК РФ).
- Ваша ситуация осложняется тем, что уведомления не приходили, а в личном кабинете начислений не было — это может быть основанием для попытки оспорить пени, но освобождения от налога не даёт.

4. Пошаговые действия
1. Получите письменное требование из ФНС (если ещё не получили) — это важно для понимания суммы и оснований начисления.
2. Обратитесь с заявлением в ФНС (через личный кабинет, МФЦ или лично) о разъяснении расчёта налога и пеней, приложите копию договора купли-продажи, укажите, что доли были проданы разными лицами, деньги поступили на разные счета, и попросите пересчитать налог с учётом раздельного получения дохода.
3. Если ФНС откажет, подайте жалобу в Управление ФНС по субъекту РФ (апелляционная жалоба).
4. Если и это не поможет — обращайтесь в суд с административным иском о признании действий ФНС незаконными (ст. 218 КАС РФ).
5. По поводу пеней: приложите доказательства отсутствия уведомлений (нет писем, нет начислений в личном кабинете), это может быть основанием для их уменьшения по уважительным причинам (ст. 112 НК РФ — о восстановлении срока по уважительным причинам).
6. Если налог и пени уже взысканы, подайте заявление на возврат излишне уплаченного налога (ст. 78 НК РФ) и пеней (если их удастся оспорить).
7. На будущее: при продаже долей разными собственниками оформляйте отдельные договоры.

5. Что нужно уточнить
- Есть ли на руках копия договора купли-продажи?
- Как именно сформулированы условия о продавцах и распределении денежных средств?
- Получала ли мама официальные письма от ФНС или судебные акты?
- Есть ли подтверждение отсутствия начислений в личном кабинете и на Госуслугах?

Вывод:
Оспорить начисление налога в текущей ситуации затруднительно — ФНС исходит из формального подхода к договору. Однако есть шанс оспорить пени, если доказать, что уведомления не поступали. Рекомендую собрать все документы и обратиться к юристу для анализа договора и подготовки мотивированного обращения в ФНС.

Для точной оценки перспектив и подготовки документов лучше проконсультироваться с юристом лично.