Как исключить студентов из РКЛ. Нарушений нет, сбой базы.?

Ситуация, которую вы описываете, к сожалению, не уникальна и достаточно типична для российского миграционного учета, в особенности — автоматизированных систем МВД, таких как РКЛ (Реестр контингента лиц, в отношении которых принято решение о нежелательности пребывания/въезда в РФ, депортации, выдворении, запрете въезда и пр.).

Ваши действия как юридического консультанта:

1. Получить письменные ответы от МВД:
Требуйте у сотрудников МВД не устных, а письменных разъяснений и ответов на ваши запросы. Это важно для последующего обжалования действий (или бездействия) госорганов.

2. Официальная жалоба (претензия) в адрес МВД:
Подайте официальную жалобу (претензию) на имя начальника территориального подразделения ГУВМ МВД или через их сайт, с просьбой разъяснить основания повторного включения студентов в РКЛ, а также с требованием устранить нарушение.

3. Запрос информации через Госуслуги:
Проверьте статус студентов через официальный сервис Госуслуг (раздел ГУВМ МВД — "Проверка наличия оснований для ограничения въезда в РФ") и сохраните результаты на дату проверки.

4. Подготовьте досудебную жалобу (в прокуратуру):
Если МВД не реагирует или продолжает давать противоречивые ответы, направьте жалобу в прокуратуру по месту нахождения подразделения МВД с описанием ситуации и приложением всей имеющейся переписки и копий документов.

5. Судебная защита:
В случае бездействия и отсутствия результата — подавайте административный иск в суд (по месту нахождения ответчика — органа МВД), с требованием признать незаконным включение студентов в РКЛ и обязать их исключить.

6. Не выезжать из РФ до разрешения ситуации:
Категорически не рекомендую выезжать студентам из России до полного устранения их из РКЛ. При повторном въезде очень велик риск отказа во въезде и аннулирования визы/разрешения, даже если вопрос "почти решён". МВД не гарантирует, что после выезда проблема исчезнет, а восстановить статус будет сложнее.

7. Взаимодействие с институтом:
Пусть институт продолжает взаимодействовать с МВД как юридическое лицо (отправляет официальные запросы, обращения от имени ректора), а также подключит региональное министерство образования (или департамент).

8. Фиксация всех действий:
Все обращения (в органы, суд, прокуратуру) — только в письменном виде через канцелярию или с отметкой о приёме, чтобы был след.

Дополнительно:
- В некоторых случаях вопросы с РКЛ решаются быстрее через Москву (центральный аппарат МВД), а не на местах. Институт может попробовать выйти на федеральный уровень через профильные министерства или ведомства.
- Причиной автоматического включения в РКЛ может быть техническая ошибка, "двойное досье", или неотработанные старые сведения, которые система автоматически подгружает. Иногда помогает обращение к IT-отделу ГУВМ МВД (через письменное заявление).

Рекомендация для студентов:
- До полного официального исключения из РКЛ и получения подтверждения (лучше — справки из МВД или выписки из реестра) не выезжать из РФ и не совершать действий, способных ухудшить положение.

Резюме:
Ваши действия — фиксировать проблему письменно, обжаловать бездействие МВД в прокуратуре и суде, не выезжать из РФ до устранения всех рисков, работать параллельно через институт и, при необходимости, через региональные органы образования.

Если потребуется, могу предложить образцы жалоб/заявлений на этот случай.