Трудовой договор?

1. Суть ситуации и правовая оценка
Вы уже использовали максимально допустимый срок пребывания в РФ по режиму 90/180 дней (на практике — 90 дней в течение 180 дней) для граждан Кыргызстана, не имеющих специальных оснований для продления. После повторного въезда вы превысили этот срок, за что были привлечены к административной ответственности по ч.1 ст. 18.8 КоАП РФ (штраф без выдворения). Сейчас вы находитесь за пределами РФ и рассматриваете возможность нового въезда и продления пребывания через трудовой договор.

2. Применимые нормы
- Ст. 5 Соглашения между РФ и Кыргызстаном о взаимных поездках граждан (от 28.03.1996): граждане Кыргызстана могут находиться в РФ без визы до 90 дней в течение каждого периода 180 дней.
- Постановление Правительства РФ № 635 от 16.06.2020: для продления срока пребывания на основании трудового договора уведомление должно быть подано, когда иностранец находится в РФ и не нарушил срок пребывания.
- Ст. 18.8 КоАП РФ: нарушение режима пребывания — штраф, возможное выдворение и запрет на въезд при повторном или грубом нарушении.

3. Риски, сроки, нюансы
- Основное условие для продления пребывания по трудовому договору: на момент подачи документов вы должны находиться в РФ законно, не превысив 90 дней. Если вы уже нарушили срок, продление невозможно — МВД отказывает в приёме документов.
- После выезда и возвращения в РФ в этом же 180-дневном периоде ваши дни пребывания суммируются. Если вы использовали 99 дней, при новом въезде вы сразу нарушаете режим.
- Штраф без выдворения не влечёт автоматического запрета на въезд, но повторное нарушение в течение года может привести к выдворению и запрету на въезд на 3 года (ст. 26 ФЗ "О порядке выезда из РФ и въезда в РФ", ст. 18.8 КоАП РФ).
- Наличие родителей — граждан РФ не даёт автоматического права на продление пребывания или получение вида на жительство, но может быть основанием для подачи на РВП (разрешение на временное проживание) или ВНЖ (вид на жительство).

4. Что делать пошагово
- Дистанционное заключение трудового договора и уведомление МВД не дадут вам права на продление пребывания, если вы въедете в РФ, уже превысив 90 дней в 180-дневном периоде.
- Перед новым въездом подсчитайте свои дни пребывания в РФ за последние 180 дней (с любого дня отсчитываете назад 180 дней и суммируете дни фактического нахождения в РФ).
- Если лимит исчерпан, дождитесь, когда в 180-дневном периоде "освободятся" дни (т.е. с момента первого въезда пройдёт 180 дней, и вы сможете въехать снова на оставшиеся дни).
- Рассмотрите вариант оформления РВП или ВНЖ по родителям-гражданам РФ — это даст право на долгосрочное пребывание и трудоустройство без ограничений 90/180.
- Не пытайтесь въехать в РФ до истечения лимита — это риск повторного привлечения к ответственности, выдворения и запрета на въезд.

5. Что нужно уточнить
- Точные даты всех ваших въездов и выездов за последние 180 дней — без этого нельзя точно рассчитать остаток допустимых дней пребывания.
- Есть ли у вас основания для получения РВП или ВНЖ (например, родители-граждане РФ постоянно проживают в РФ).

Заключение:
В вашем случае продление пребывания по трудовому договору невозможно, если на момент подачи документов вы уже превысили лимит 90 дней в 180-дневном периоде. Для легального пребывания в РФ рекомендую рассмотреть оформление РВП или ВНЖ по родителям. Для точного расчёта дней и оценки ваших шансов обращайтесь к юристу по миграционному праву.