В военкомате сказали нужно пройти медкомиссию у меня категория В я могу от неё отказатся?

Да, проведение медицинской комиссии при направлении на военные сборы в России возможно и часто является обязательным этапом. Согласно статье 55 Федерального закона "О воинской обязанности и военной службе" № 53-ФЗ, граждане, направляемые на военные сборы, подлежат медицинскому освидетельствованию (медицинской комиссии) для установления годности к прохождению сборов.

Порядок проведения такой комиссии схож с тем, который применяется при призыве на военную службу. Медицинская комиссия проводится военным комиссариатом по месту жительства гражданина. На основании решения комиссии выносится заключение о годности или негодности к военным сборам по состоянию здоровья.

Таким образом, если вы получили повестку на военные сборы, военкомат вправе пригласить вас для прохождения медицинской комиссии, и это является законным требованием. Неявка на медицинское освидетельствование без уважительных причин может повлечь административную ответственность.

Резюме:
Да, медицинская комиссия для прохождения военных сборов предусмотрена законом и проводится по направлению военного комиссариата.